分集介绍第17集剧情
高翰文(谭凯 饰)将沈一石(赵立新 饰)临死前述说的朝廷诸多不可告人的账目一一背给海瑞(黄志忠 饰)听，海瑞不禁感慨官场之贪墨皆始于内廷。海瑞再次嘱咐高翰文唯有沉默，才能出狱。次日，芸娘(王雅捷 饰)陪同被押解的高翰文一起进京。 嘉靖皇帝几十年不上朝，但整个大明朝的财政收支却一直掌握在其手里，除了修醮炼丹以外，最让他关注的便是计算整个国家的财政收支。嘉靖帝命太监将杨金水(王劲松 饰)密送进京城的四箱账册一一查点，算出浙江官场这二十年贪墨沈一石的一百万匹丝绸怎么也有七八百万两白银！嘉靖帝立即召见了星夜兼程、秘密进京、已经筋疲力尽的胡宗宪(王庆祥 饰)，严厉质问新安江大堤决口之事和浙江官场贪墨之风。胡宗宪忠言进谏：国事艰难，如果兴起大狱，牵及内阁和六部九司，大明朝立时大乱，恳请嘉靖帝在适当的时候彻查。 为试探严嵩(倪大红 饰)，嘉靖帝又命胡宗宪将四箱账册连夜送进严府。严嵩不看账册，又一次暗中保护了自己。
第16集剧情
高翰文(谭凯 饰)查抄沈一石(赵立新 饰)的账册和家财的下落，竟一无所获，便与同来的锦衣卫分头赶往巡抚衙门和织造局。郑泌昌、何茂才正火烧账册、毁灭证据，将高翰文挡在巡抚衙门外。但让郑泌昌和何茂才万万没有想到的是杨金水(王劲松 饰)还有同样四口木箱，装着沈一石二十年来所有的账册，原封不动送往京城交给吕芳，上奏嘉靖帝。 郑泌昌、何茂才等浙江的官员贪墨巨资，现在又拿不出军饷供应前方抗倭。为给朝廷一个交待，密谋移罪高翰文“办案不力，账目被销毁，大量赃款下落不明”，让其做替罪羊。 倭寇在东南沿海烧杀淫掠，戚家军数千将士在已经断粮数日后仍然坚守苦待、伺机杀敌！东南局势危急，高翰文押着仅有的军需到前方见了胡宗宪(王庆祥 饰)。胡宗宪敏锐地断定不出一个月，朝廷就会在浙江掀起大案，劝高翰文立刻找朝廷派来的锦衣卫主动请罪，请他们把自己槛送京师！ 杨金水将沈一石的死讯告诉给了芸娘(王雅捷 饰)，言沈一石临死前让自己把芸娘托付给了高翰文，并把一个生满铜锈、上了锁的铜匣交给了芸娘，说是让她和高翰文保命的。 每次戚家军击退倭寇后，总会留下一些无家可归的妇女，她们大都留下做了戚家军的军户。戚继光(陈之辉 饰)将带领百姓奋勇杀敌立了头功的齐大柱(晋松 饰)，引见给了胡宗宪。此时的胡宗宪将随身的宝剑赠给了齐大柱，流露出些许无奈的退意。
